Dans le village caché de Konoha vit Naruto, le pire garnement de l'académie des ninjas. Le passe-temps favori de celui qui rêve de devenir le nouvel Hokage est de faire les quatre cents coups! Mais la route est longue pour devenir un vrai ninja...

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Hinata s'est entraîné dur et n'est plus la petite fille timide qui doutait d'elle sans cesse. Elle le prouve en se sortant des griffes des ennemis et en aidant ses amis. Ils ont enfin pour eux l'insecte flaireur, mais Naruto fait encore des siennes et ce n'est pas l'odeur du bandeau de Sasuke que l'insecte va flairer à son éclosion...

Le 5ème Hokage confie une mission à Lee, Tenten, Neji et Naruto :aller enquêter sur des imposteurs se faisant passer pour la famille Kurosuki ont débarqué dans un village près de la mine d'or aux Oxalides. Sous prétexte de protéger les villageois, ces voyous volent l'or de la mine et terrorisent les habitants en procédant à des exécutions sommaires.

Cette mission est l'occasion pour Lee présenter à ses compagnons « grand-mère Sansho » patronne et cuisinière de l'échoppe du curry providentiel qui lui sauva autrefois la vie grâce à son curry. Lee apprend que le petit fils de cette dernière a rejoint Raiga, le tyran qui vole la mine d'or aux Oxalides et qui terrorise le village. Il va tout faire pour le remettre sur le droit chemin.

Neji, malgré son byakugan, a bien du mal a vaincre l'association Raiga / Ranmaru. Quelle est donc cette mystérieuse technique qui leur permet de déjouer le byakugan ? c'est leur union qui leur apporte cette force. Mais resté seul, Ranmaru à qui la solitude pèse, n'a plus le goût de vivre.

La mission de l'équipe de Konoha est maintenant presque arrivée à son terme. Lee s'engage à « ré-éduquer » Karashi, à condition que ce dernier s'engage à faire sa recette au curry qui requinque. Ranmaru raconte son passé solitaire, dans son village où il était considéré comme un monstre à cause de son don de voyance.

Raïga n'a pas disparu et Ranmaru grâce à son don de voyance l'a senti et part à sa recherche. Il est prêt à donner sa vie pour celui qui autrefois le sauva, mais c'est sans compter avec l'intervention de Naruto, Neji, Tenten et Lee qui sont bien décidés à en finir une bonne fois pour toutes avec Raïga et à sauver Ranmaru de l'emprise maléfique de son soi-disant sauveur.

Lee se retrouve seul face à Raiga, pendant que Tenten et les autres se dépêchent de leur rapporter le Curry de la Vie. Raiga bat Lee sans difficulté et l'envoie au bas de la falaise. Lee et les autres reçoivent le Curry de la Vie.

On attribue un escadron d'étudiants à chaque Genin qui doit les diriger lors d'une mission : ils doivent tous courir jusqu'au sommet d'une montagne pour aller chercher un rouleau de parchemin et le rapporter ensuite. Et vous ne devinerez jamais qui Naruto doit mener jusqu'au sommet !

Naruto, Hinata et Kiba sont envoyés en mission. Ils doivent capturer un voleur du nom de Gosunkugi. Chemin faisant, ils rencontrent un autre chasseur de prime qui le recherche, lui aussi.

On apprend que Sazanami serait effectivement un criminel du nom de Touchiki, recherché pour le meurtre de trois personnes d'une même famille. Mais il s'avère qu'il est innocent et bien déterminé à capturer le vrai meurtrier pour le prouver. Sazanami s'allie au groupe de Konoha afin de parvenir à arrêter Gosunki une fois pour toutes.

Alors que Gai et Lee quittent Konoha pour une mission, deux inconnus se déguisent en Gai et Lee et s'introduisent dans le village afin d'y découvrir ses secrets. Mais personne n'est dupe de leur déguisement, personne sauf... Naruto qui souhaite s'entraîner avec eux.

Naruto, Tenten et Neji voyagent jusqu'au Pays des Oiseaux pour exterminer le guerrier maudit, un fantôme.

Naruto et les autres tentent de prouver que Kômei est responsable de l'existence du fantôme. Cependant, ce que Naruto et la bande vont découvrir révèle encore davantage d'énigmes à résoudre.

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